个体工商户经营者与法人代表在法律性质上有着明显的区别。个体工商户经营者是指自然人以个人名义从事工商业经营活动，其承担的责任和义务与其个人财产无关。而法人代表则是公司、企业等法人实体的合法代表人，其行为将代表整个法人实体承担责任。

在权利和义务方面，个体工商户经营者享有较大自主权，可以单方面决定经营策略和经营行为。而法人代表的行为必须符合公司章程和法律规定，多数情况下需要董事会或股东会授权方可进行。

在经营责任方面，个体工商户经营者对经营活动的风险承担个人全部财产责任，即个人财产与经营风险无法分离。而法人代表的责任范围通常局限于公司财产范围内，个人财产相对安全。

在税收和法律责任方面，个体工商户经营者需承担个人所得税、增值税等税费，并且个人与经营单位没有法律分别。而法人代表在公司经营过程中，公司所得税、企业所得税等税费由公司和法人分别承担，个人责任和公司责任有明确分界。